虚拟药筛平台
选择应用->应用领域->药物设计->"vs platform",如下图
第一步:首体文件准备 首先选择受体,可通过上传PDB文件获取,亦可通过输入pdb编号,检索获得。右侧可视化展示区会实时展示加载的pdb文件。根据需要选择对接的分子片段,例如本例中可选择seg1,protein,选择的分子片段会高亮显示。选择完成后点击确认选择,右侧可视化区域会展示已选择的分子片段。根据需要选择受体的处理方式,选中复选框即可。例如选择补全电荷,加氢操作。
第二步:配体文件准备 选择分子库和子库,或自定义配体筛选规则
第三步:配置文件准备 根据受体和配体对接口袋位置,定义活性位点和格点尺寸,右侧分子以表面方式展示,并实时展示口袋的位置和大小,辅助选择。
第四步: 提交计算及查看结果 提交到国家高性能计算环境,进行虚拟筛选流程。任务结束后,会展示计算结果,并提供TOP10个分子集合供下载,以进行下一步计算。