计算应用

通过图形化界面直通国家高性能计算环境,应用环境中的软硬件资源进行科学计算。目前支持26款软件(EspressoMD, PGAP, PGAPX, AutoDock Vina, CPC2, DL_POLY, GROMACS, LAMMPS, NAMD, Gaussian, NWChem, ABINIT, Quantum Espresso, AMBER, CASTEP, CP2K, CPMD,DMol3, GAMESS, DFTB+, Forcite, Amorphous Cell, Molpro, ADF, reaxFF, AutoDock)、 8个工作流(Glimmer3, KaKs_Calculator, LGC, ParaAT, Prodigal, Gaussian09+NWChem, Tinker+Gaussian09, CHARMM)以及一个特色应用--虚拟药筛平台。

想用本平台计算资源进行计算,必须要先注册中国科学院超级计算环境网格账号。进入“首页”, 点击"登录"(网格账号直接登录)。

选择应用,按照“应用类型”,“应用领域”及“应用场景” 等分类选择具体应用。例如点击“应用类型”,选择计算软件,可列出相关计算软件。

在具体应用软件图标上悬浮,可显示软件版本和简单介绍。

点击具体应用,可进入到软件提交页面,例如点击“DMol3”,进入到DMol3软件提交页面。

  1. 点击具体应用,可进入到软件提交页面,例如点击“DMol3”,进入到DMol3软件提交页面。
  2. 选择运行参数(Tips:c_zjin队列请选择CPU数目小于等于20,可以获得更快的调度)。
  3. 点击选择可用队列。
  4. 点击“提交任务”

提交任务后,页面会自动跳转到结果页面,在此页面会显示作业运行状态,作业号,运行时间等信息。例如下面的任务状态是“运行中”,作业号是1690,等待时间为37秒,运行时间是45分钟42秒。

点击“账户“可查看所有用户提交的作业任务。

点击具体任务ID,可详细查看任务信息及计算结果文件。例如点击“1680”,可查看作业号为1680的计算结果。